La Commission PSE constitue un organe chargé de remettre des avis au Gouvernement soit à la demande de celui-ci soit d'initiative. Ces avis peuvent porter sur les réglementations en vigueur, sur leur mise en œuvre ou sur toute question ayant trait à la Promotion de la Santé à l'Ecole.

Elle est composée de 18 membres représentants :

• les fédérations ou associations de pouvoirs organisateurs de services de Promotion de la Santé à l'Ecole;
• les médecins travaillant dans le secteur de la Promotion de la Santé à l'Ecole;
• le personnel infirmier travaillant dans le secteur de la Promotion de la Santé à l'Ecole;
• le Conseil supérieur de promotion de la santé;
• le Conseil supérieur des centres Psycho-Médico-Sociaux;
• le Service général des affaires pédagogiques, de la recherche en éducation et du pilotage de l'enseignement;
• les chefs d'établissement de l'enseignement ordinaire ou spécialisé, fondamental ou secondaire, de la Fédération Wallonie-Bruxelles;
• les fédérations de Pouvoirs Organisateurs (PO) de l'enseignement libre subventionné;
• les fédérations de Pouvoirs Organisateurs (PO) de l'enseignement officiel subventionné;
• les fédérations d'associations de parents de l'enseignement officiel;
• les fédérations d'associations de parents de l'enseignement libre;
• les Centres Locaux de Promotion de la Santé;
• le service communautaire de promotion de la santé agréé, ayant pour mission de tenir à jour un registre territorialisé des offres et des besoins de formation/accompagnement/appui des services et des centres, désigné par le Ministre ayant la Santé dans ses attributions;
• des représentants des Ministres et Administrations concernés.

Lorsqu'un avis concerne la Promotion de la Santé dans l'enseignement supérieur, la Commission est complétée par la présence de représentants des Ministres et Administrations concernés ainsi que par la présence des représentants des étudiants.​​​​​​​